肠道功能紊乱是多种原因造成的结果，是可以自愈的，只要找到了引起肠功能紊乱的原因，除去病因，病人就能自愈。

1、有些患者对一些食物不耐受，如喝牛奶会拉肚子，吃花生会引起腹痛，则病人可以不喝牛奶，不吃花生，这样自然就能痊愈。

2、如果病人找不到肠道功能紊乱的原因，就需要用药物来调节肠道功能，有一些病人通过药物调节，也可以恢复到正常的状态，但是有一小部分的病人会长期和肠功能紊乱共存，通常很难治愈。