肠镜检查的好处是可以清楚地检查疾病，肠镜检查的缺点是肠镜检查会导致患者不适甚至严重的不良反应。

1、肠镜检查可以清楚地检查胃肠道，帮助医生做出明确的诊断，从而获得正确的治疗，缓解疼痛。

2、肠镜检查是一种有创的检查，在肠镜检查过程中，患者会感到不适，也有穿孔和出血的风险，此外，肠镜检查要做好肠道的准备，患者通常需要服用泻药，许多患者有很大的不良反应。

3、肠镜检查的目的是检查、诊断和消除疾病，如果怀疑肠道有疾病，就要做肠镜检查。