卵巢囊肿大于4cm以上的，如果出现相应其他的问题，可能要借助手术治疗，对于卵巢的叫赘生性的囊肿，生理性的可能随着月经的第二次来潮，囊肿会自然消失。

还有一些巧克力囊肿，是子宫内膜异位症造成，可以经过用药物来控制达到治疗效果，例如孕激素的治疗，以及促性腺激素释放激素治疗等，都可以对它有相应的治疗，如果囊肿属于肿瘤，它不能完全通过一些药物处理，一定要手术去除。