鼻窦炎的发病原因非常复杂，有自身的原因，也有外界的原因，自身的比如有解剖发育的异常，如果有严重的鼻中隔偏曲，出现鼻窦炎的机会比较多，如果鼻甲发育得过大，也会影响鼻窦的引流，也会造成鼻窦炎。

细菌、病毒还有真菌感染都会引发鼻窦炎，一些外伤引起的感染也会引发鼻窦炎，有糖尿病的病人抵抗力非常弱，这类病人往往会出现真菌的感染，叫真菌性鼻窦炎，有过敏因素引起的鼻窦炎叫变异性鼻窦炎。