打疫苗发烧有两个问题，第一个是孩子在打疫苗时没有做预检，有轻微感冒，当天或头一天已经不舒服，家长不知道，或去打疫苗的路上出现了感冒也有可能，这是巧合性的发烧。

另一个情况是打疫苗的反应，因为打疫苗实际上是给孩子用减毒或完全灭活的菌体或抗原，刺激机体产生抗体、产生免疫，这个过程也可以想象为一个轻微的感染，通过感染机体才获得免疫力，有些孩子反应较强烈而发烧。