在甲状腺激素的合成过程中需要碘和甲状腺球蛋白结合，但有些自身免疫性的甲状腺病的患者还会产生甲状腺球蛋白抗体，如果甲状腺球蛋白和甲状腺球蛋白抗体相结合，也会影响甲状腺激素的合成，可能会最终形成甲状腺功能减退的发生。

对于甲状腺癌的病人，甲状腺球蛋白是判定病人预后很重要的指标，要保证结果监测的可靠性，通常在进行甲状腺球蛋白监测时，还要同步监测甲状腺球蛋白抗体，在最终结果的判定方面会更准确。