一般原则上要求分开做，因为胃镜和肠镜检查，用的镜子不一样，检查前的准备也不一样，检查的环境要求也不一样，如果一起做，可能会容易引起环境的污染，设备的污染，甚至感染。

但是在特殊情况下，比如做无痛胃肠镜时，要尽量减少麻醉次数1，避免对患者造成药物、经济或者身体上的负担，可以考虑同时做，还有一些特殊情况、特殊病人需要尽快明确诊断或者减少多次检查的痛苦，也可能会同时做，但是一般的原则是把胃肠镜检查分开做。