子宫内膜薄主要是有以下原因，第一是遗传性的因素，比如说染色体病、特纳综合征；第二是医源性操作，比如部分女性把做人流当做避孕的一种方法，不采取节育措施或者不节育，反复做人流会造成内膜功能层的损伤，导致内膜变薄并无法再恢复，反复人流还会引起粘连，导致不孕；第三是内分泌疾病和免疫性疾病引起的内膜薄。

对于医生而言，在操作人流、引产、扩宫时，操作要轻柔，术前准备适当，尽量减少人为的医源性损伤。