卵巢囊肿的治疗主要是根据囊肿的大小、生育情况、囊肿的性质来综合考虑，如果是囊肿在5cm以下，尤其是囊性的，定期复查即可；如果是子宫内膜异位的囊肿，巧克力囊肿，4cm以上，尤其合并有不孕，可以做腹腔镜囊肿的剥除术；如果囊肿较大、实性的、回声不好、肿瘤标志物有异常以及不能排除恶性的，就需要尽早手术，避免恶变或是恶性肿瘤。

良性的卵巢囊肿手术效果都挺不错，对于年轻的女性或生育年龄的女性，只是剥除掉囊肿，正常的子宫、输卵管都可以保留，不会影响生育能力。