病人的指甲凹凸不平，可能是甲癣、甲营养不良、系统性疾病等引起的。

1、甲癣即为灰指甲，多由真菌感染造成，病人患有甲癣后，可能会出现指甲凹凸不平。

2、如果病人患有银屑病、糖尿病、甲亢等系统性疾病，可能会出现指甲的凹凸不平。

3、扁平苔藓会导致指甲有翼状胬肉，进而出现指甲的凹凸不平。

4、建议病人及时就医，由医生进行诊断，然后进行针对性的治疗。