肛门痉挛性疼痛的原因总体有两大类，第一类是功能性的痉挛性疼痛，第二类是器质性的痉挛性疼痛。

1、功能性的痉挛性疼痛指肛门括约肌的不自主收缩，从而导致肛门痉挛性的疼痛，患者要进行检查，排除器质性的肛门痉挛性疼痛。

2、如果是器质性的痉挛性疼痛，则可能是肛门周围的炎症、肛门直肠的异物、肛门直肠的肿瘤引起的。