头孢菌素与阿奇霉素均有其自己的适应证、不良反应，正确用药、选择合适的剂型、给药途径，可以将药物的不良反应控制在可控范围内，使用这两类药物是安全有效的。

1、医生在给患者使用头孢菌素前需要做皮试，注意其有无出现过敏反应，严重时可能会出现过敏性休克。

2、若是长期使用头孢菌素，可能会出现肾毒性与神经毒性的问题。

3、患者使用阿奇霉素时，可能会出现恶心、呕吐等，长期使用会损害肝脏功能。