巧克力囊肿指的是卵巢子宫内膜异位症，卵巢子宫内膜异位症经常见的表现就是痛经以及不孕，根据囊肿的大小，患者生育的需求，以及子宫内膜异位的严重程度，采取不同的治疗办法，如果非常小的异位囊肿患者有生育的要求，及时的妊娠是最好的的卵巢巧克力囊肿的治疗的办法。

但是如果囊肿大到一定的程度，造成了盆腔的免疫性的改变以及输卵管的粘连，影响到自然受孕的功能，要进行及时的治疗。