CT是X线的断层显像，因此是具有辐射作用的，对于不能够接受辐射的人群是不建议做CT的，但CT有非常好的优势，耗时非常短，对于钙化、出血等显像更为敏感。

磁共振没有任何的辐射，非常安全，小孩、孕妇都可以做，同时磁共振的优点在于对于脑部的组织的分辨率更高，对脑的灰白质、脑室，甚至脑膜等显影远高于CT，磁共振要求病人体内不可以有金属的物质，磁共振耗时比较长，对于病人的一般状况有要求，如果病人的呼吸不平稳，生命体征不平稳，做检查会有一定的风险。