巧克力囊肿是卵巢上子宫内膜正常，在子宫腔里子宫内膜移位到卵巢上，每个月月经周期子宫内膜会剥脱来月经，在卵巢上子宫内膜也会随着月经周期激素的变化会来月经、出血，所以卵巢上就形成囊肿，而囊肿因为有出血，囊液像巧克力，所以叫巧克力囊肿，学名叫子宫内膜异位症卵巢囊肿。

如果是巧克力囊肿的患者，又是没有生育过的女性，应该积极用药物进行治疗，同时进行辅助生殖技术帮助患者尽快怀孕，解决生育的问题，如果再有巧克力囊肿做手术，不会影响后面的生育功能，对于年轻的女性有巧克力囊肿要到医院进行合理的诊治，在没有怀孕前、没有生孩子前少做手术，临床上巧克力囊肿的恶变率是1%，医生要做很好的判断，既能够治疗让患者怀孕，又不做手术，还要保证囊肿没有恶性变，年轻的女孩恶性变的几率比较低，年龄越大，恶变机会越高。