脖子两侧疼，看他疼的位置，甲状腺位于气管的前方，也就是环状软骨的下方，胸骨柄的后上方以及两侧的胸锁乳头肌的中间部位，如果这个部位疼痛，多考虑是甲状腺，如果这个部位以外的地方疼，就考虑别的问题，比如最常见的颈部淋巴结的一些疾病，或者是乳头肌或者其他的疾病，具体要到医院来进一步检查确诊；

甲状腺出现问题也会疼痛，比如常见的亚急性甲状腺炎，或者是急性化脓性甲状腺炎，还有由于甲状腺结节的破裂出血，突发的甲状腺区的疼痛，具体是哪一情种况，要到医院来就诊，通过彩色超声检测鉴别诊断。