食管癌的鉴别诊断很多，主要的要鉴别食管平滑肌瘤、贲门失弛缓症，还有一些良性的食管狭窄，还有肝硬化引起的食管静脉曲张，都需要与食管癌相鉴别，肝硬化引起的食管静脉曲张，往往出现的是串珠样的改变，钡餐透视是看到串珠样的改变。

平滑肌瘤虽然出现了吞咽困难，也出现了肿块影子，但是黏膜是完整的，贲门失弛缓症是贲门括约肌弛缓状态，所以持续痉挛，好发于青壮年，时轻时重，不是进行性的，而且上段的食管扩张很明显，而且胃镜下黏膜很完整的。