部分对疼痛耐受力比较差的病人进行输尿管软镜的操作，需要通过静脉复合麻醉或者是脊髓麻醉来处理，脊髓麻醉包括硬膜外麻醉或者腰麻；对于输尿管下段或者接近膀胱的检查，部分病人可采取局麻来处理，可以在膀胱镜室进行，病人比较方便，但是稍微会有点痛苦，术后可能会有不舒服的症状。

输尿管镜的操作，对输尿管的松弛度要求比较高，在全麻或者腰麻的情况下，相对比较安全，但是患者需要在手术室，麻醉的状态下进行操作。